Teknik Desain Primer

Primer merupakan komponen PCR yang sangat menentukan akurasi sekuen DNA yang ingin diamplifikasi. Urutan nukleotida primer akan menjadi penentu pada bagian mana primer akan menempel (anneal) pada genom. Jika urutan nukleotidanya tidak sesuai dengan kode gen yang kita inginkan, dapat dipastikan produk PCR yang dihasilkan akan keliru. Oleh sebab itu, sebelum melangkah pada tahap amplifikasi [...]

Cara Menelusur Sekuen Whole Genom Bakteri (contoh: Bacillus subtilis)

1. Masuk ke homepage NCBI, 2. BLAST, 3. NUCLEOTIDE BLAST (n-blast), 4. Masukan sekuen gen lengkap yang sudah kita punya , (tunggu hingga muncul opsi sumber penelusuran whole genom) 5. Pilih NCBI genom, 6. Klik Blast, (muncul opsi nama-nama spesies yang wholem  genomnya telah berhasil disekuensing) 7. Pilih Bacillus subtilis, (muncul hasil) 8. Klik kode [...]